Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD47Q08722 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD47Q08722 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD47Q08722 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD47Q08722 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms