Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms