Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFITM3Q01628 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFITM3Q01628 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms