Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB1P62873 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB1P62873 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB1P62873 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms