Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP107P57740 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP107P57740 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP107P57740 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP107P57740 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP107P57740 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP107P57740 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms