Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKAA2P54646 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKAA2P54646 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms