Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFIP2P53365 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP2P53365 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms