Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SMARCA2P51531 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms