Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB5CP51148 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB5CP51148 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms