Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NESP48681 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NESP48681 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NESP48681 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NESP48681 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NESP48681 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NESP48681 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NESP48681 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NESP48681 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NESP48681 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NESP48681 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NESP48681 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NESP48681 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NESP48681 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NESP48681 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NESP48681 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NESP48681 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
NESP48681 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NESP48681 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NESP48681 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NESP48681 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NESP48681 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms