Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSN1S1P47710 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms