Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms