Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRIP30626 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRIP30626 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRIP30626 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRIP30626 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRIP30626 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRIP30626 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms