Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOS1P29475 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOS1P29475 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NOS1P29475 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOS1P29475 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOS1P29475 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOS1P29475 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms