Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms