Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP1A3P13637 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1A3P13637 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms