Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP3P12645 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP3P12645 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMP3P12645 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BMP3P12645 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms