Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms