Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM6P0DI80 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM6P0DI80 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms