Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L8P0C7I0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms