Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOC3P02656 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms