Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRPM2O94759 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRPM2O94759 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms