Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCP1A6NGW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRCP1A6NGW2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms