Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL33A6NCF5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms