Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms