Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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