Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HECTD4Q9Y4D8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HECTD4Q9Y4D8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HECTD4Q9Y4D8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HECTD4Q9Y4D8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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