Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED7Q9Y3B3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms