Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms