Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN2Q9ULH4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN2Q9ULH4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN2Q9ULH4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN2Q9ULH4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms