Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRNDQ9UKY0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms