Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP25Q9UHP3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms