Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C8orf17Q9NRJ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms