Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIX2Q9NPC8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms