Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKRIP1Q9H875 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms