Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM6SF1Q9BZW5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF1Q9BZW5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms