Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRTQ9BXP5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms