Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAGR1Q9BTK6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms