Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms