Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms