Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF558Q96NG5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF558Q96NG5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms