Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms