Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRIG1Q96JA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms