Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC34Q96HJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms