Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms