Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms