Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms