Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE6

FBXL13, F-box/LRR-repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL13Q8NEE6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXL13Q8NEE6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL13Q8NEE6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL13Q8NEE6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL13Q8NEE6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL13Q8NEE6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL13Q8NEE6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms