Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM3Q8NE01 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM3Q8NE01 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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