Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RASSF3Q86WH2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASSF3Q86WH2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms